Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FARSAQ9Y285 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms