Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUDCQ9Y266 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms