Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1BQ9UPS6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1BQ9UPS6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms