Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRQQ9UMZ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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