Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PACSIN3Q9UKS6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms