Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms