Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CYTH4Q9UIA0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CYTH4Q9UIA0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms