Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN11AQ9UI33 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN11AQ9UI33 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms