Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX20Q9UHI6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDX20Q9UHI6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms