Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
KDM5BQ9UGL1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDM5BQ9UGL1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms