Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNQ9P2M7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms