Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IGSF9Q9P2J2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IGSF9Q9P2J2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms