Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.07
CCDC180Q9P1Z9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
CCDC180Q9P1Z9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
CCDC180Q9P1Z9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms