Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GDE1Q9NZC3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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