Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXL2Q9NZ53 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms