Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VNN3Q9NY84 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms