Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A12Q9NXJ0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms