Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM248Q9NWD8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms