Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms