Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6BQ9NRW1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6BQ9NRW1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms