Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK5

AGO4, Protein argonaute-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGO4Q9HCK5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGO4Q9HCK5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGO4Q9HCK5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms