Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLSPNQ9HAW4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms