Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC52A2Q9HAB3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms