Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms