Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
THSD7BQ9C0I4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THSD7BQ9C0I4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms