Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP4Q9C0A0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms