Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXQ1Q9C009 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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FOXQ1Q9C009 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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FOXQ1Q9C009 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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FOXQ1Q9C009 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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FOXQ1Q9C009 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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FOXQ1Q9C009 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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FOXQ1Q9C009 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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FOXQ1Q9C009 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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FOXQ1Q9C009 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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FOXQ1Q9C009 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXQ1Q9C009 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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