Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms