Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCAPERQ9BY12 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCAPERQ9BY12 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms