Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP2Q9BX26 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms