Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms