Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGIP1Q9BQI5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms