Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms