Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms