Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SORCS2Q96PQ0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SORCS2Q96PQ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms