Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms