Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RDH12Q96NR8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms