Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED3Q96IU2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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