Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCANQ96GW7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms