Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MRPL53Q96EL3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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