Protein–RNA interactions for Protein: Q96A25

TMEM106A, Transmembrane protein 106A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106AQ96A25 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM106AQ96A25 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms