Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX21Q969T3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX21Q969T3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms