Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TSR2Q969E8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR2Q969E8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms