Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNAAF4Q8WXU2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAAF4Q8WXU2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms