Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC4Q8WW27 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms