Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms