Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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