Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DDX54Q8TDD1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX54Q8TDD1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms