Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms