Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE23Q8NDY6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms